駁二藝術特區原本是高雄港第三船渠內，編號二號淺水接駁碼頭的倉庫群。而第三船渠在日治時期西元1912年進行的打狗港第二期築港工程時雛形已成。大規模的改變打狗港與愛河地貌的填土造陸、築港工程，擴建鹽埕南邊的碼頭十座到打狗川河口，並且也填出五福路以西的「沙仔地」（現稱為公園路）。

      第三船渠為淺水碼頭，為倉儲貨物接駁碼頭。船渠旁的倉庫為製糖株式會社所有，戰後為台灣糖業公司接收。台灣糖業榮景時，此地的倉庫倉儲滿倉；並且貨車、搬運工人、接駁船隻往來繁囂忙碌著，載運糖包的貨車甚至大排長龍，還曾經影響到公園路的交通呢！到了民國七O年代以後因為台糖競爭力的消逝，各地製糖工廠相繼停工，位於駁二碼頭的倉庫群逐漸冷清，甚至閒置著並且未使用而影響了鹽埕區的市容及經濟活力。

      西元2000年高雄市政府結合文建會閒置空間再造方案，將駁二倉庫改造為具前衛、實驗、創新的藝術空間。爾後，又有一群藝術家與熱心藝文活動的藝術界人士於民國90年5月8日成立「駁二藝術發展協會」，並開始推動駁二碼頭作為愛河文化流域的開端；經營團隊歷經了駁二藝術發展協會及樹德科技大學，西元2006年由文化局接手經營，4月開始，駁二藝術特區再出發，首展推出「南方生活陶，駁二賞陶趣」，於5月初結束。駁二倉庫及台糖倉庫也陸續推出其他展演，包括台灣偶像文化特展、高雄國際鋼雕藝術節及生活工藝系列活動等，將來會陸續推出各項展覽。而過去港邊載送貨物的西臨港線鐵道，現在成為高雄最熱門的水岸輕軌，貫穿駁二藝術特區，市民可搭乘輕軌至駁二欣並賞港口風光。